近 2,000 個 AI 代理 32 分鐘分析 800 萬個腦細胞
OpenAI 周三（21 日）公布，與生物科技初創 PerturbAI 及美國研究機構 Scripps Research 合作，動用數以千計由 GPT-Rosalind 驅動的 AI 代理，分析 PerturbAI 的全腦 CRISPR 基因圖譜。OpenAI 生命科學主管 Joy Jiao 在 PerturbAI 同日發出的新聞稿表示，「同時運行近 2,000 個代理，顯示了我們可以如何擴大生物數據的解讀規模」。
這份圖譜由科學家在老鼠腦內逐一關掉近 2,000 個基因，再記錄約 800 萬個腦細胞各自的反應。PerturbAI 指，代理用 32 分鐘完成分析並整合結果；同一工作若由人手逐個基因分析及翻查文獻，估計要數月至一年。
每個代理負責一個基因
據 OpenAI 介紹，每個代理只負責一個基因：檢視相關細胞數據、搜尋科學文獻，再寫出解釋，最後所有結果合併成一份可供搜尋的「推理圖譜」，把基因、細胞反應、過往研究和可能的生物機制連在一起。
OpenAI 又指，在最大工作量下，單一代理只引用了 11 篇文獻，分散式代理則引用逾 700 篇。PerturbAI 的新聞稿又指，人類生物學專家在不知來源的情況下比較兩種報告，75% 的時候選了分散式代理的解讀。
膽固醇線索仍待實驗驗證
OpenAI 舉出的例子是 DCTN1 基因。這個基因與佩里綜合症（Perry syndrome，一種病徵與柏金遜症相似的罕見神經退化疾病）有關。在老鼠腦數據中，關掉 DCTN1 會令負責製造膽固醇的基因表達增加。GPT-Rosalind 提出一個可能解釋：膽固醇或許未能送到神經細胞需要的位置，細胞於是製造更多。
OpenAI 表示，這為科學家提供一個可以測試的具體機制，如獲證實，可成為研發神經退化疾病新療法的方向。至於恢復膽固醇運送能否保護神經細胞，目前仍未有實驗測試。
研究結果已於 10 月 16 日以預印本形式上載至 bioRxiv，題為「Distributed AI agents enable comprehensive discovery of biological insights at scale」，第一作者為 Scripps Research 神經科學系的 Alexander Sun，通訊作者包括同系的 Xin Jin、PerturbAI 的 Grace Zheng 及 OpenAI 的 Joy Jiao，尚未經同行評審。
PerturbAI 與 OpenAI 擴大合作找藥物靶點
PerturbAI 行政總裁兼聯合創辦人 Grace Zheng 表示，「生物醫學實驗產生數據的速度，已快過科學家解讀的速度」。兩間公司表示，下一步會用同一套做法配合 PerturbAI 的活體實驗數據，合作尋找新的藥物靶點，即藥物可以針對的基因或蛋白。
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